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為了培育學生對菇菌類栽培技術、發酵技術與產品功能評估有專業能力的培訓，及提供學生對菇類產業的了解與訓練，本系申請科學園區人才培育補助計畫模組課程『菇菌類栽培、固態發酵暨功能性產品評估專題實作模組課程』。本模組課程的特色是『菇類栽培理論與實務的結合，發酵技術及產品功能性評估實作能力的養成』。

本模組課程I：『菇菌類栽培與成分分析』，教學內容將藉由原理講授搭配操作訓練與實務經驗分享，讓同學們瞭解並熟悉菇菌類栽培的原理與應用範圍，有助於學生未來從事於菇菌類之研究與應用。另外本課程結合生物科技常用分析原理及應用，有系統的介紹用於生物活性有效成份篩選及分析評估的技術。將各類儀器之特性、操作問題及解決情形作一實際介紹，以提高教學效率及實務操作應用，並能學以致用，舉一反三。

本模組課程II：『生物轉化發酵系統與產品行銷企劃』之教學內容將包括菇類發酵實務、菇類保健產品開發。本課程將擔任樞紐角色延續基礎課程，修課同學在大一大二階段皆有修過微生物學、生物化學、儀器分析等課程。對於微生物(如乳酸菌)、營養素代謝與能量利用及發酵儀器有基本的認識。在本課程中生物轉化發酵系統與產品行銷企劃將延續與融合上述基礎課程，以業界實例來介紹由搖瓶發酵至業界發酵量產及發酵產品的製程。而產品行銷部分將以授課講師所屬公司的標竿產品為例，介紹該產品的行銷策略並由修課學生以模擬產品來進行行銷企劃的練習。

本模組課程III：『菇類栽培與產品功能性評估專題實作』將提供選修學員分組實務操作，提升技術，並由期末海報競賽分享實作經驗，交流實作心得，藉此減少學生對於未來就業方向的不確定性，還可以增加學生自信心。