大學部:

廣開通識選修課：學生需在社會科學類與人文藝術類等兩類課程中，依均衡原則，修習專業領域外之兩類通識課程計四學分。學生能依個人興趣修習，以培養學生在知識領域的廣度，並可避免知識偏食。

專業選修課程之開設：本系開設專業選修課程28學分佔專業課程之31%，而針對專業選修課程38學分中的8學分，學生可以至外系選修有興趣的課程，提供學生更自由選修的機會。此外，提供生技醫藥、保健生技與實務技能等專長領域的課程選擇，以提升學生專業能力。模組課程包括: 生技醫藥模組和保健生技模組二類學科專業模組，以滿足學生多元選擇之需求，協助學生更具就業競爭力。

開設跨系院學程：提升學生的多元專業能力、實務能力與就業競爭力。本系學程主辦學程有：生物醫學學程、毒理學分學程。  跨系院學程包括：營養生技學程、食品分析及水質檢測學程、醫療健康與生活品質促進跨域學程及資源再生產品開發學分學程。

研究所:
本所課程之開設均符合培育重點，說明如下：

生技醫藥相關課程：細胞生物學特論、生物統計學、免疫技術、天然物化學、基因工程、分子醫學、分子檢測、組織工程、奈米醫藥、藥物動力學、蛋白質工程及細胞工程等。

保健生技相關課程：分子保健劑、酵素工程、生技產業、植物化學技術及專利實務與行銷管理